Sa famille — son père était confiseur et sa mère vendeuse — s'installe à Bulle alors qu'il a 6 ans. Après ses études de commerce, Passionné de violon depuis l'âge de 7 ans, Jean Daetwyler part en 1927 poursuivre des études musicales à Paris, au Conservatoire de Paris, puis à la Schola Cantorum et à l'École César-Franck. Il a travaillé avec des professeurs comme Vincent d'Indy, Jean de Valois, Guy de Lioncourt et Charles Koechlin.
Dans les années 80, il a dirigé "L'Oratorio pour notre temps" composé par Félix Lisiecki, paroles Françoise Chauchat Caubel
